كوين الأغشية الحيوية يلعب دوراً حاسماً في مقاومة البكتيريا للمضادات الحيوية من خلال حماية البكتيريا من خلال بنية ثلاثية الأبعاد، وإنشاء بيئة داخلية تعزز تبادل الجينات المقاومة، وتفعيل آليات مقاومة محددة مثل إنتاج إنزيمات تعطيل المضادات الحيوية. الأغشية الحيوية تجعل العدوى البكتيرية أكثر استعصاءً على العلاج، حيث يمكن للخلايا الموجودة داخلها أن تظل خاملة وغير نشطة استقلابياً، مما يسمح لها بالبقاء في تركيزات عالية من المضادات الحيوية.