(Ecological Study of Antibiotic- Resistance Profile of Fecal Coliforms Isolated from Some Sites of Tigris River within Baghdad City, Iraq)(دراسة بيئية للبكتيريا القولونية البرازية المقاومة للمضادات لبعض المواقع في نهر دجلة ضمن مدينة بغداد، العراق)مناقشة
by
قسم علوم الحياة
College of Science for Women
تم جمع عينات المياه موسمياً (رطب وجاف) من أربعة مواقع على نهر دجلة ضمن الحدود الداخلية لمدينة بغداد: جسر المثنى، جسر الصرافية، جسر السنك، وجسر الجادرية، تم عزل البكتيريا القولونية عن طريق تقنية الترشيح الغشائي وتحديد البكتيريا القولونية البرازية من خلال التحليل الكيميائي الحيوي ونظام الفايتك ٢VITEKE ، وأُجري اختبار تقدير حساسية المضادات الحيوية للبكتريا وفقًا لطريقة الأنتشار القرصي Kirby-Bauer ضد ١٥ مضادًا حيويًا انتقائيًا، الكشف عن ثلاث جينات مقاومة الكينولون (qnrB ، qnrS، parE ، armA) وجين مقاومة أمينوغليكوزايد (armA)
تهدف الرسالة الى دراسة بعض المتغيرات البيئية (الفيزيائية والكيميائية) لمياه نهر دجلة وتحليل ملف المضادات الحيوية لعزلات البكتيريا القولونية البرازية المعزولة، وحساب مؤشر مقاومة المضادات الحيوية المتعددة، والكشف عن جينات مقاومة المضادات الحيوية (qnrB، qnrS، parE، armA) في عزلات البكتيريا القولونية البرازية بأستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR)
وخلصت الدراسة الى ان تحليل نتائج الخصائص الفيزيائية والكيميائية لعينات المياه لنهر دجلة اظهرت أن المستوى الكلي لكل من ( الأملاح الذائبة الكليةTDS، الرقم الهيدروجيني pH،التوصيلية الكهربائية EC،المتطلب الحيوي للأوكسجين BOD٥ والأوكسجين الذائب DO) في مياه نهر دجلة كان ضمن الحدود المسموح بها، باستثناء العكارة التي سُجلت قيمة أعلى من قيم معايير منظمة الصحة العالمية (<٥ NTU)، وكشفت النتائج الحالية عن قيم مؤشر مقاومة المضادات الحيوية المتعددة (Index ( MAR والتي سجلت قيمًا عالية في المواقع الأربعة لنهر دجلة، تراوحت بين ٣٣٪ و٩٣٪، مما يشير إلى جرعة عالية من المضاد الحيوي المستخدم ، وهذه الدراسة الأولى من نوعها في استخدام مؤشر MAR في العراق كدليل لوجود المضادات الحيوية في نهر دجلة، كما كشفت نتائج المقاومة أن معظم عزلات الأشريكية القولونية E. coli والكلبسيلا الرئوية K. pneumoniae مقاومة لواحد أو أكثر من العوامل المضادة للميكروبات بنسبة (٦١.٤٨٧٪) و (٦٥.٩٢٨٪) على التوالي. وأظهرت هذه العزلات مقاومة لجينات الكينولون وأمينوغليكوزايد (qnrB، qnrS، parE، armA) والتي يمكن تفسيرها بوجود جينات المقاومة في البكتريا القولونية البرازية.
امتياز
The study includes collecting water samples seasonally (wet and dry) from four sites on the Tigris River within the internal borders of Baghdad city: Al-Muthana Bridge, Al-Sarafiya Bridge, Al-Senak Bridge, and Al-Jadriya Bridge. Coliforms bacteria were isolated using membrane filtration technniqe , and fecal coliform bacteria were identified using biochemical analysis and the VITEKE 2 system. antibiotic sensitivity testing was conducted for bacteria according to the Kirby-Bauer disk diffusion method against 15 selective antibiotics, and to detect three quinolone resistance genes (parE, qnrB, qnrS), and the aminoglycoside resistance gene (armA).
The thesis aims to study some environmental variables (physical and chemical) of the Tigris River water, analyze the antibiogram profile for isolated fecal coliform bacteria , calculate the multiple-antibiotic resistance index (MAR Index) , and detection of antibiotic resistance genes (qnrB, qnrS, parE, armA) in fecal coliform bacteria isolates using PCR technique.
The study concluded that the physical and chemical analysis of the samples from the Tigris River sites showed that the total level of (TDS, pH, EC, BOD5 and DO) in the Tigris River water was within the permissible limits, except for the turbidity, which was recorded higher than the WHO standards (<5 NTU). The current results also revealed the values of the multiple antibiotic resistance index (MAR), which showed an increase in the four sites of the Tigris River, ranging between 33% and 93%, indicating the presence of a high dose of the antibiotic used. The resistance results also revealed that most of the E. coli and K. pneumoniae isolates were resistant to one or more antimicrobial agents, at a rate of (61.487%) and (65.928%), respectively. These isolates showed resistance to quinolone and aminoglycoside genes (qnrB, qnrS, parE, armA) in the bacterial isolates,which may be explained by the presence of resistance genes in fecal coliform bacteria.
Excellent
