الميكروبات البشرية هي مجموعات ميكروبية تشكل علاقة تكافلية مع البشر. هناك ما يصل إلى 1000
الأنواع الموجودة على سطح الجلد البشري والجهاز المخاطي، ومن بينها الكائنات الحية الدقيقة المعوية التي تجذب الاهتمام الأكبر.
كبداية الجهاز الهضمي، يعد تجويف الفم أيضًا موطنًا ميكروبيًا مهمًا في جسم الإنسان خط الدفاع الأول ضد مسببات الأمراض التي تدخل الجسم. وقد كشفت العديد من الدراسات أن ديسبيوسيس الميكروبي عن طريق الفم.
لا يمكن أن تساهم في أمراض الفم فحسب، بل أيضًا في أمراض الجسم كله والحالة الصحية. يمكن للكائنات الحية الدقيقة عن طريق الفم أن تدخل إلى الجهاز الهضمي عن طريق اللعاب والطعام، أو تدخل إلى الدورة الدموية من خلال كسر الفم، مما يسبب الالتهابات الجهازية والأمراض المرتبطة بالشيخوخة بما في ذلك بعض الروابط السببية لمرض الزهايمر