اكتشاف الدواء هو العملية التي يتم من خلالها تحديد الكيانات العلاجية الجديدة المحتملة، باستخدام مزيج من النماذج الحسابية والتجريبية والترجمية والسريرية. وعلى الرغم من التقدم في التكنولوجيا الحيوية وفهم الأنظمة البيولوجية، فإن اكتشاف الدواء لا يزال عملية طويلة ومكلفة وصعبة وغير فعالة مع معدل استنزاف مرتفع للاكتشافات العلاجية الجديدة. تصميم الدواء هو العملية الإبداعية لإيجاد أدوية جديدة بناءً على معرفة هدف بيولوجي. بالمعنى الأكثر أساسية، يتضمن تصميم الدواء تصميم جزيئات مكملة في الشكل والشحنة للهدف الجزيئي الحيوي الذي تتفاعل معه وبالتالي سترتبط به. يعتمد تصميم الدواء في كثير من الأحيان ولكن ليس بالضرورة على تقنيات النمذجة الحاسوبية. تم تصميم AutoDock للتنبؤ بكيفية ارتباط الجزيئات الصغيرة، مثل الركائز أو مرشحي الأدوية، بمستقبل ذي بنية ثلاثية الأبعاد معروفة
