يتفاعل الجهاز المناعي للجسم مع مكونات الوجبات السريعة باعتبارها عدوى بكتيرية، مما يجعله أكثر عدوانية على الأعضاء الداخلية للجسم على المدى الطويل، ويسهم في الإصابة بأمراض أبرزها تصلب الشرايين والسكري. وأظهرت الدراسة أن الوجبات السريعة التي تحتوي على نسب مرتفعة من الدهون والسكر والسعرات الحرارية، زادت من نسب الالتهابات في الجسم بصورة تماثل تلك التي يتعرض خلالها الجسم لعدوى بكتيريا خطيرة.